Если я вас правильно понял, и вы хотите вызывать прерывание по определенному уровню напряжения, то средствами данного камня это невозможно(точнее можно, но устанавливать напряжение придется с помощью делителя на резисторах). Для программного изменения порога как минимум вам нужен будет ЦАП, как вы понимаете, его у нас нет.
И опять же, для ЦАП нужно будет стабильное напряжение питания, тк при изменении напряжения будет уходить и напряжение на выходе ЦАП.
Также можно конечно использовать компаратор подключив один выход к ИОН, а второй к средней точке делителя напряжения, соответственно повлиять программно на эту установку не получится.
И по поводу изменения встроенного ИОН, не стоит его так часто дергать, он крайне нежный и от любого лишнего движения просаживается, особенно при переключении мукс. Если нужны более менее точные показания, то лучше использовать максимальный пределитель АЦП(128). При пределителе ниже 32 начинается погода на Марсе(при тактирование 16МГц).