Сразу не отвечал, был немного наказан за неверное ведение ответов...
Как не странно, моя последняя версия оказалась верной. При питании от ЮСБи, схемотехника ардуино питалась от 4.7V, примерно 0.3 падало на диоде.
Если питать через Vin, то схемотехника ардуино питается от 5 вольт и происходят глюки.
Я прогнал тест работы ардуино, от 2.3 до 5 вольт... Пока напряжение не достигло 4.75V все работает. Но как питание переходит данный рубеж, начинаются глюки. Самое интересное, даже при напряжении 2.5V ардуино работает идеально.
В общем я запитал ардуино через диод Шотки, и у меня все работает как часы. На питании получилось где то 4.6V.
Отвечая на вопрос зачем я питаю от своего источника питания, потому, что моё уст-во питается в диапазоне от 5 до 25 вольт... а на ардуино не рекомендуется подавать бОлее 15 вольт.
Резюмирую.
Ардуинки все идеально рабочие, понравился старт ардуинки- загрузка мгновенная, на старых ардуинках загрузка 2 сек.
Ну а с питанием переживем.
Вот видео как стартуют старая и новая ардуинки -