@かねき,
Если вы уверены, что все подключено правильно, RESET проходит, настройки тоже правильные, т.е. уверены, что именно внутренний загрузчик не работает, то
Теоретически WeMos d1 mini можно использовать как ISP для записи загрузчика. Но надо или самому модифицировать скетч LarduinoISP, или искать может кто это сделал до вас.
Учитывая, что плата перестала правильно отрабатывать ранее загруженный скетч, есть вероятность, что она сломалась, а не слетел загрузчик. В таком случае будет трудно понять - неправильно модифицирован LarduinoISP или же LGT сломан.
По трудозатратам возможно проще купить новую плату.
Посмотрите, отвечает ли реально LGT на запросы stk500_getsync()
(по морганию светодиода RX на USB-TTL, или осциллографом)