Не совсем понятно. Библиотеку заливал... Это как? Библиотеки нужно просто закинуть в папку по пути C:\Program Files\Arduino\libraries. данные библиотеки необходимые лежат в самом архиве проекта. Если энкодер рабочий и подключен правильно, проект теплицы залит в ардуино, то должно работать без шаманства. Ну или опишите ваши шаги по порядку, что делали. в самих библиотеках править ни чего не надо.