Внимательно просмотрел видео. Однозначно не могу сказать, что на нём видна синхронизация фантомных цифр и неоновых ламп, я увидел больше засветку. Хотя понятно, что при выпайке резистора, если цифры сохраняются, на засветку уже не кивнёшь. Несколько смущает также довольно заметное изменение яркости цифр по времени, может, конечно, несоответствие частоты съёмки и переключения.
Фантомные цифры могут возникать только на выключенных лампах, то есть, когда в динамической индикации отображаются другие разряды. При этом должно подаваться анодное напряжение откуда-то, пусть и через большое сопротивление, а значит - где-то есть утечка.
Что предлагаю сделать: в коде выключить отображение десятков секунд и посмотреть, есть ли фантомы? Отключить анод десятков секунд (это можно попробовать сделать прямо на разъёме, немного подогнув один из пинов) и посмотреть, есть ли фантомы?
В первом эксперименте можно будет точно их зафиксировать, во втором - определить где утечка: на верхней или нижней плате.